После перечисления поставщику предоплаты в счет предстоящей поставки товаров (работ, услуг) вправе предъявить к налоговому вычету НДС по нему при условии получения от поставщика авансового счета-фактуры. Впоследствии НДС с перечисленной предоплаты нужно восстановить в том квартале, в котором суммы "входящего" НДС по приобретенным товарам (работам, услугам) подлежат вычету (подп. 3 ст. 170 НК РФ).
Следовательно, обязанность по восстановлению НДС с предоплаты у покупателя возникает в том квартале, в котором покупатель принял на учет приобретенные товары, получил от поставщика счет-фактуру и намерен использовать эти товары для операций, облагаемых НДС (подп. 3 п. 3 ст. 170, п. 2 ст. 171, п. 1 ст. 172 НК РФ).
Такую позицию поддерживают как чиновники (письма Минфина России от 10.01.2022 № 03-07-11/15, от 17.11.2020 № 03-07-11/99951, п. 3 письма ФНС России от 29.12.2018 № СА-4-7/26060), так и суды (Определение Конституционного Суда РФ от 08.11.2018 № 2796-О, Определение Верховного Суда РФ от 06.12.2021 № 308-ЭС21-22469).
На практике возможна ситуация, когда поставщик отгружает товары в одном налоговом периоде, а покупатель получает их в другом налоговом периоде. Поэтому возникает вопрос: в каком периоде нужно восстановить НДС с предоплаты: на дату отгрузки или на дату поступления товаров.
По мнению чиновников, восстанавливать НДС с предоплаты следует в том периоде, когда покупатель получил товары, в счет которых была перечислена предоплата, и у него возникло право на вычет "входящего" НДС. Об этом говорится в письме Минфина РФ 12.12.2022 № 03-07-11/121613.