Что делать, если НДС начислен ошибочно?

Если Вы неправильно рассчитали НДС (применили не ту ставку, не использовали льготу, не учли место реализации и т. д.), то это не беда. Все можно исправить, если договориться об этом с контрагентом. Но обо всем по порядку.

В неприятную ситуацию попал налогоплательщик. В 2014-2019 годах он выполнял строительно-монтажные работы на объектах недвижимости, в том числе расположенных на территории Республик Абхазия и Южная Осетия. В контрактах на выполнение работ на территории указанных государств стоимость указанных работ определена с учетом НДС. Налогоплательщик составил акты выполненных работ с НДС и выставил счета-фактуры. Заказчик произвел оплату выполненных работ с учетом НДС и принял «входящий» НДС к вычету.

В 2022 году налогоплательщик пересмотрел подход к начислению НДС по строительно-монтажным работам на территории Республик Абхазия и Южная Осетия. Поскольку местом реализации работ не является территория РФ, налогоплательщик представил уточненные декларации по НДС за 2016 – 2022 годы.

В уточненных декларациях налогоплательщик исключил из раздела 3 стоимость строительно-монтажных работ и суммы НДС по ним. Одновременно он отразил эти стоимость этих работ в разделе 7 декларации по коду 1010812. «Входящий» НДС по товарам, работам, услугам, которые были использованы на указанных объектах, ранее  принятый к вычету, налогоплательщик восстановил.

В такой ситуации, если налогоплательщик обнаружил ошибочное начисление НДС, то он вправе провести перерасчет налоговой базы и суммы НДС. Поскольку на выполненные работы налогоплательщик выставил счета-фактуры с НДС, заказчик принял «входящий» НСД к вычету. Поэтому, по мнению ФНС РФ, перерасчет ошибочных сумм НДС у налогоплательщика возможен только в случае:

• внесения сторонами в контракты согласованных изменений в части ставки НДС и цены работ, и
• аннулирования выставленных заказчику счетов-фактур.

Законодательством РФ не определены ни само понятие «аннулирование», ни порядок аннулирования первичных учетных документов и счетов-фактур, содержащих ошибки.

Для выполнения этой процедуры необходимо договориться с контрагентом о признании ошибочно сформированных документов недействительными, то есть не влекущими гражданско-правовые последствия. Гражданское законодательство не исключает такую возможность.

Способ признания ошибочных документов недействительными стороны могу закрепить в отдельном соглашении.

Такие рекомендации содержатся в письме ФНС РФ от 31 октября 2022 г. № СД-4-3/14664.